Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEUROD1Q13562 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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