Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP3B2Q13367 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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