Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXF2Q12947 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXF2Q12947 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXF2Q12947 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXF2Q12947 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXF2Q12947 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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FOXF2Q12947 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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