Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms