Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFFO1Q0D2I5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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