Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms