Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK18Q07002 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK18Q07002 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK18Q07002 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms