Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms