Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OTUD4Q01804 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
OTUD4Q01804 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms