Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTRA4P83105 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms