Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSNK2A1P68400 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms