Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP46P62068 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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USP46P62068 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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USP46P62068 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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USP46P62068 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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USP46P62068 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP46P62068 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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USP46P62068 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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