Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRP54P61011 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRP54P61011 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRP54P61011 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SRP54P61011 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRP54P61011 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRP54P61011 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRP54P61011 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRP54P61011 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRP54P61011 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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