Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HADHBP55084 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HADHBP55084 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HADHBP55084 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms