Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNB3P54284 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms