Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms