Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTGIRP43119 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms