Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CHRNA7P36544 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms