Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms