Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB2P29323 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms