Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDSP20132 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDSP20132 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDSP20132 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms