Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAV1P15498 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAV1P15498 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms