Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP2C9P11712 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms