Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RALAP11233 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RALAP11233 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RALAP11233 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms