Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM58BPP0C7Q3 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms