Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRCP08575 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRCP08575 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRCP08575 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRCP08575 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRCP08575 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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