Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4FO95754 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms