Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms