Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XIRP2A4UGR9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms