Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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