Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP15Q9Y4E8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP15Q9Y4E8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP15Q9Y4E8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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USP15Q9Y4E8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP15Q9Y4E8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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