Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HPS5Q9UPZ3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HPS5Q9UPZ3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms