Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS7AQ9UBW8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms