Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC180Q9P1Z9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms