Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMEM27Q9HBJ8 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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TMEM27Q9HBJ8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMEM27Q9HBJ8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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