Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TRIM4Q9C037 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TRIM4Q9C037 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM4Q9C037 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRIM4Q9C037 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRIM4Q9C037 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRIM4Q9C037 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TRIM4Q9C037 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRIM4Q9C037 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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