Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFT27Q9BW83 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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