Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH3GL2Q99962 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms