Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NOTCH4Q99466 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms