Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAP3Q96P50 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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