Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CHFRQ96EP1 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CHFRQ96EP1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CHFRQ96EP1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CHFRQ96EP1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CHFRQ96EP1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CHFRQ96EP1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CHFRQ96EP1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHFRQ96EP1 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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