Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PHF3Q92576 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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