Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COLGALT1Q8NBJ5 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms