Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC33Q8N5R6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC33Q8N5R6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms