Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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HDDC3Q8N4P3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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HDDC3Q8N4P3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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HDDC3Q8N4P3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HDDC3Q8N4P3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HDDC3Q8N4P3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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