Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATG4DQ86TL0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms