Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms