Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCBE1Q6UXH8 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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