Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C4orf17Q53FE4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms