Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms